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为什么要写计算机病毒的论文(为什么现在计算机病毒少了)

新冠疫情席卷全球,

从年初的仅几人感染不明肺炎,

到数月后肆虐全球导致1670万人感染,

66万人死亡,病死率最高达28%,

你是否也感到疑惑,

曾经的SARS和MERS(中东呼吸综合症)都未曾像

新冠病毒一样给各国社会带来如此漫长且严重的冲击?

为什么要写计算机病毒的论文(为什么现在计算机病毒少了)插图

为什么新冠病毒具有如此凶猛的感染性和传播性,它的生物信息和SARS和MERS相比有什么异同,是否有可能是它们变异的结果,又如何借助生物信息工具找到蝙蝠等野生动物体内的新冠病毒和人类宿主的病毒的差异?17年前,中国在治疗SARS患者的工作中已积累相当丰富的经验,但为何生物技术经过近20年发展,现在仍然对新冠病毒束手无策,它的致病机制是怎样的,治疗的关键钥匙在哪里?

这个暑假,我们将带领中美同学们跟随斯坦福大学导师从生物信息学的角度解读上述问题。生物信息学, 被称为 “代码遇见生物学的地方”,通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析, 达到提取数据所蕴含的生物学意义的目的。

生物信息学在线科研项目视频

1.项目详情

项目阶段

我们的生物信息学概论项目将分为三个阶段,Stage1基础阶段,Stage 2实战阶段和Stage 3科研设计阶段。

第一阶段,学生将从生物信息学的基本知识(例如核酸和蛋白质)及其在科研中的应用开始学习。接着,同学们将在导师的引领下,探索生物学科科研常用的数据库。课程将重点介绍美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库。学习完课程以后,学生们需要参加小测验来检测自己对课程内容的理解。我们还将给同学们提供PPT和课堂笔记,其中会包括一些小练习来帮助学生应用自己所学的知识。除此以外,我们每周会给同学们布置一些论文阅读任务。学生需要基于阅读内容写一份总结。每周预计投入时间5小时。

第二阶段,学生们将运用自己学到的知识以新冠病毒结构来进行案例学习。除了分析病毒的蛋白质序列以外,学生还将使用生物信息学工具来比较新冠病毒序列与其他指定序列,进而学会从运用生物信息数据来阐明病毒的关键信息。

第三阶段,通过分析基因工程中感兴趣的基因并提出方法,学生将有机会发展自己的研究项目。学生们有三个星期的时间来准备有关其研究设计的论文。

项目时间

Stage 1基础阶段:2020年8月17日至9月13日

Stage 2 实战阶段:2020年9月14日至9月20日

Stage 3 科研设计阶段:2020年9月21日至10月11日

项目收获

· 理解基因工程和CRISPR-Cas9

· 理解分子生物学的中心法则

· 熟悉NCBI数据库的基本操作

· 从零开始完成生物信息学研究论文

· 全英文授课,提高英语能力

· 中英文助教,辅助学习

· 和中美两国的同学一起交流学习

· 按时完成课程内容,获得项目证书

· 完成Stage 3的学员将获得推荐信

· 参与每周线上直播课程和一对一答疑,直接对话斯坦福导师

报名详情

目标学员:无任何年龄、专业限制。无论你是高中生、大学生还是在职,无论你是希望这份经历帮助你留学、升学还是就业,只要你对生物工程,化学工程,基因工程等感兴趣并且英语沟通流利都欢迎加入到我们的项目中。

授课方式:录播+直播+在线一对一答疑我们每周课程由录播和直播相结合。录播内容学员根据自己时间进行学习。直播每周一次一个小时,总结本周所学内容并围绕重点内容进行讨论,并进行答疑。除了在直播期间进行答疑外,同学们如有任何问题可以通过Canvas教学平台留言、发送电子邮件或者预约zoom进行答疑。

项目地点:全程线上(录播直播相结合,直播环节支持回放)

为什么要写计算机病毒的论文(为什么现在计算机病毒少了)插图1

2.导师介绍:Natasha Jagnandan

为什么要写计算机病毒的论文(为什么现在计算机病毒少了)插图2

Natasha Jagnandan目前是斯坦福大学化学工程专业的博士生。她毕业于康奈尔大学史密斯化学与生物分子工程学院化学工程专业。除了化学工程课程,Natasha还学习过生物分子工程和计算机科学的课程。同时她也是植物基因组学和基因工程实验室的研究员。她研究方向的很大一部分涉及生物信息学。Natasha目前对医学领域的研究很感兴趣。在斯坦福大学,她从事转译研究。

3.课程安排

stage 1

为什么要写计算机病毒的论文(为什么现在计算机病毒少了)插图3

stage 2

病毒是包裹在蛋白质外壳中的DNA或RNA。我们可以使用在线生物信息学数据库来分析病毒的DNA、RNA或蛋白质外壳的序列。在本案例研究中,学生将使用NCBI数据库分析COVID-19(也称为SARS-CoV-2)的序列。学生还将使用数据库访问该案例研究中确定的其他序列的信息。然后,学生将使用称为基本局部比对搜索工具(BLAST)的生物信息学工具来比较COVID-19的序列与其他指定序列。通过该练习,学生将学习如何使用生物信息数据库来帮助阐明病毒的关键信息。例如,我们将利用生物信息学提供给我们的线索来发现一种病毒如何变得更具感染性。

我们将为学生提供有关病毒基本原理的课程视频和笔记,同时提供一个带有案例问题的工作表来指导学生完成案例研究。学生将有一周的完成案例分析。

stage 3

学生将选取感兴趣的基因,并提出计划,说明如何改造细胞以改变基因表达来为治疗疾病提供可能性。为此,学生应考虑不同的增强子,启动子和终止子以及不同基因的注释。学生将要选择一种对细胞进行基因改造的实验室方法,描述这种方法并阐述选择的理由。

同学们将有三周的时间来准备有关其研究设计的论文。

更多内容详情可以私信留言噢~。

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